本院於90年成立南區職業衛生保健中心，90~92年承辦行政院衛生署國民健康局之計劃案，希望職業衛生保健中心大力推廣職場健康營造，使職場員工在身理、心理的需求亦能有所幫助。雖93年起未再承接國健局計劃案，但本中心擁有相當豐富且專業的教師群，設有專屬網站及諮詢電話，並和院內相關單位及院外之政府機關、公司單位結合共同推廣職場健康促進活動，其地理位置含括雲林縣、嘉義縣、嘉義市、台南縣、台南市共五個縣市，目的期望使雲、嘉、南地區職場員工重視衛生教育和健康促進營造，對工作環境有更深一層的了解，以改善個人行為及控制環境，達到保障勞工職業健康、落實健康促進、預防職業傷害的理念，使職場是安全衛 生的職場，員工是健康快樂的員工。

  成立宗旨：1.建立職場自主性之健康促進角色

                       2.提昇職業相關疾病通報系統功能

                       3.改善勞工健康檢查品質

  任    務：1.辦理職業衛生醫事專業人員研習會

                   2.建立南區職業傷病諮詢輔導服務網

                   3.成立南區縣市健康促進示範工廠模式 

                   4.配合職業相關疾病網路通報系統及功能改善