佳里奇美醫院前身為佳里醫療社團法人佳里醫院,乃為響應衛生署對於醫療資源缺乏地區之「醫療發展基金」獎勵政策下所興建,於84年興建完成。民國100年5月,由奇美醫療財團法人董事長許文龍創辦人,與原佳里醫療法人董事會簽訂併購合約書,啟動更名改制。醫療無縫接軌的準備程序,於當年9月7日,更名為「奇美醫療財團法人佳里奇美醫院」,由奇美創辦人許文龍董事長、廖錦祥董事長、奇美總院邱仲慶院長親自揭牌啟用,並派任總院外科部温義煇主任擔任首任院長,成為全國第一家醫療財團法人併醫療社團法人之醫院。

  佳里奇美醫院籌備期之短短兩個月間,完成醫療無縫接軌。醫院整體不論醫療系統、管理系統,全然更新與奇美醫療體系各院區一致,並在不到一年的時間,通過新制醫院評鑑最高榮譽『優等』,及教學醫院『合格』之成績,實屬難得。近五年來,醫療服務量成長近一倍,衛生局督導考核屢獲『特優』,獲獎無數,深獲地方民眾及主管機關之肯定,足見奇美醫療體系的用心,及佳里院區同仁之努力。

  目前,因為原有醫院空間嚴重不足,病人候診與候床十分辛苦,遂於103年經營決策委員會與董事會,通過醫院擴建案,興建八千多平方公尺之新醫療大樓,並於105年1月15日,由許文龍創辦人、廖錦祥董事長等人親臨主持動土典禮。大樓工程預計於107年年底完工。此外,為考量員工福利與居住品質,105年董事會並通過佳里院區員工宿舍之購地自建案,期使佳里奇美醫院,能有更穩固的經營基礎服務地方、造福鄉梓。佳里奇美醫院將秉持奇美實業、與奇美醫療體系之宗旨,提供優良的醫療品質,成為最佳的醫療機構。